Présentation du poste

Ingénieur(e) en biostatistiques ou bio-informatique. L'ingénieur devra assurer la réalisation des analyses de l’effet des interactions entre génome et pollution atmosphérique modélisé par ATMO sur la fonction respiratoire, les facteurs de risques cardiovasculaires et les marqueurs biologiques dans les enquête transversales ELISABET (environ 3200 personnes dans les communautés urbaines de Lille et Dunkerque) et Mona Lisa (environ 1600 sujets à Lille). Il réalisera ainsi que la veille scientifique sur les méthodes d'analyse bio-informatiques et statistiques de ces données.
Savoir-faire : Manipulation de Linux et des logiciels d'analyses statistiques / génétiques (SAS, R, PLINK, SNPtest…). Langages de script (Perl, python …).

Responsable scientifique

Luc Dauchet

Laboratoire d'affectation : UMR1167

Work-package de rattachement :

WP3

Personne recrutée :

Manon Muntaner

Prise de fonction : 01/07/2019

Présentation du poste

Analyse des bases de données de paléobiodiversité du Phanézoroïque

Responsable scientifique

Thomas Servais et Claude Monnet

Laboratoire d'affectation : EEP

Work-package de rattachement :

WP3

Personne recrutée :

Axelle Zacai

Prise de fonction : 01/10/2017

Présentation du poste

Le recruté traitera des relations climats/systeme de reproduction des espèces, et climat/physiologie hivernale des espèces, en lien avec leur répartition spatiale.

Responsable scientifique

Jean-François Arnaud & Anne Duputié

Laboratoire d'affectation : EEP

Work-package de rattachement :

WP3

Personne recrutée :

Claudia Ortiz

Prise de fonction : 15/02/2017

Présentation du poste

Dans le cadre du Programme Régional CLIMIBIO (Contrat de Plan Etat-Région « Hauts de France » 2015-2020 et FEDER), l’équipe « Changements environnementaux et adaptation » de l’Unité de recherche Eco-Evo-Paléo (UMR CNRS 8198) recrute un ingénieur d’étude sur la thématique du WP5 « Étude des processus de recolonisation des friches industrielles par des espèces pionnières : origine et processus ».

Objectif : Comparaison de méthylomes chez Noccaea caerulescens, espèce de milieux fortement anthropisés.

Ce projet de recherche vise à tester l’hypothèse selon laquelle l’espèce Noccaea caerulescens serait capable de coloniser rapidement des milieux fortement anthropisés grâce à des mécanismes épigénétiques. Pour cela, des individus de milieux anthropisés et non anthropisés ont été cultivés en conditions contrôlées. Le séquençage de leur génome traité au bisulfite (afin d’identifier les sites méthylés sur la séquence d’ADN) et de leur transcriptome a déjà été réalisé. Il s’agit maintenant de mettre en relation ces deux informations par bioinformatique afin d’identifier des régions génomiques dont le profil de méthylation serait différent entre individus, et  correspondrait en même temps à des variations d’expression sur des gènes particuliers.

Missions

  • Stockage et gestion de données NGS
  • Alignement de génomes et de transcriptome
  • Analyse de transcriptome
  • Mise en relation de l’analyse de transcriptome avec les variations de profils de méthylation

Responsable scientifique

Hélène Frérot

Laboratoire d'affectation : EEP

Work-package de rattachement :

WP3

Personne recrutée :

Marie-Joe Caram

Prise de fonction : 01/10/2017

Présentation du poste :

Assistant en expérimentation et techniques biologiques. Les missions seront les suivantes :

  • Adapter et mettre en place des processus d'élevage ou de maintenance de lignées animales
  • Adapter et mettre en œuvre les technologies spécifiques de biologie moléculaire

Responsable scientifique :

Céline Wichlacz

Laboratoire d'affectation : EEP

Work-package de rattachement :

WP3

Personne recrutée :

Christophe Calarnou

Prise de fonction : 01/01/2018

Présentation du poste :

Expérimentation animale, biologie moléculaire, histologie. Réalisation des protocoles expérimentaux chez la souris et analyse des prélévements après exposition.

Responsable scientifique :

Cécile Vignal

Laboratoire d'affectation : U995 INSERM

Work-package de rattachement :

WP3

Personne recrutée :

Christophe Waxin

Prise de fonction : 17/10/2016

Présentation du poste :

Etude écologique des réseaux d'interactions plantes-pollinisteurs et étude des mécanismes d'adaptations des pollinisateurs aux changements environnementaux (ressources nutritionnelles locales, climat, compétiteurs, etc.). A4.

Responsable scientifique :

Yves Piquot

Laboratoire d'affectation : EEP

Work-package de rattachement :

WP3

Personne recrutée :

Alessandro Fisogni

Prise de fonction : 01/10/2016

Présentation du poste :

Master 2 en économie ou en sociologie avec une ouverture sur les questions liées au changement climatique (biodiversité, gestion des ressources, gestion des risques). Participation aux enquêtes de terrain, recueil de données qualitatives nécessaires WP3, WP4 et WP5 et interaction avec les membres du Clersé mobilisés sur le projet CLIMIBIO (appui méthodologique, dialogue théorique et analytique, interaction avec les autres champs disciplinaires du projet). Participation avec les chercheurs à l'élaboration d'outils méthodologiques et aux échanges scientifiques.

Responsable scientifique :

Thierry Ribault

Laboratoire d'affectation : CLERSE

Work-package de rattachement :

WP3, WP4 et WP5

Personne recrutée :

Gregory Pitrel

Prise de fonction : 01/02/2017